Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL2P13500 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCL2P13500 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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