Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms