Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM225BP0DP42 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms