Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms