Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTMAP06454 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTMAP06454 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTMAP06454 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTMAP06454 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTMAP06454 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTMAP06454 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTMAP06454 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTMAP06454 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTMAP06454 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms