Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1AO95602 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms