Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX6O95503 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX6O95503 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX6O95503 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms