Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CLDN9O95484 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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CLDN9O95484 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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CLDN9O95484 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CLDN9O95484 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CLDN9O95484 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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CLDN9O95484 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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CLDN9O95484 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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CLDN9O95484 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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CLDN9O95484 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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CLDN9O95484 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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CLDN9O95484 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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