Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAPBO95292 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms