Protein–RNA interactions for Protein: O94844

RHOBTB1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB1O94844 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOBTB1O94844 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms