Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAK2O60296 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms