Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAG9O60271 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms