Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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