Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB2O43679 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB2O43679 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LDB2O43679 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms