Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms