Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP3O14828 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms