Protein–RNA interactions for Protein: O00585

CCL21, C-C motif chemokine 21, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21O00585 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL21O00585 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL21O00585 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL21O00585 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL21O00585 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL21O00585 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL21O00585 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL21O00585 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL21O00585 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL21O00585 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL21O00585 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL21O00585 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL21O00585 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL21O00585 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL21O00585 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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