Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFKBIEO00221 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFKBIEO00221 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms