Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms