Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTMR11A4FU01 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms