Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
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