Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms