Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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