Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNRF3Q9ULT6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms