Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms