Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ABCF2Q9UG63 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCF2Q9UG63 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCF2Q9UG63 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms