Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CCDC88CQ9P219 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC88CQ9P219 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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