Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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