Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EMILIN3Q9NT22 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms