Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFDN4Q9NQP4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms