Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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