Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCO2Q9BYV7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms