Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIFKQ9BYG3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms