Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms