Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VN1R3Q9BXE9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms