Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms