Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IFT27Q9BW83 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms