Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGIP1Q9BQI5 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms