Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS8Q99627 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms