Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CCL13Q99616 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CCL13Q99616 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CCL13Q99616 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CCL13Q99616 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CCL13Q99616 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CCL13Q99616 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL13Q99616 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms