Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ1Q96JM4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms