Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms