Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00526Q96FQ7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms