Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC97Q96F63 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms