Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC10A4Q96EP9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC10A4Q96EP9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms