Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms