Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms