Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC1Q96C34 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms