Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms