Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX13Q92968 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms